中控台采用了全新的设计，比Q5的内饰设计更加活泼，功能分区清晰明了。但仔细观察后会发现，有很多似曾相识的功能模块。比如像A1一样手动收折的MMI屏幕，还有放在中控台上的MMI操作系统。
虽然位置变了，但MMI系统的操作方式并没有改变。面板上的按键和旋钮的质感和触感都很出色，这也是奥迪一贯坚持的内饰标准。试驾车上标配了奥迪驾驶模式选项，在MMI系统中和中控台上都能够很直观的操作，这套系统的选装价格并不贵，35TFSI车型只需2500元就可选装这套系统。
方向盘尺寸适中，上面的多功能按键已经更新为奥迪的最新样式，滚轮和按键相结合的操作方式依旧直观，同时滚轮的质感也非常出色。方向盘背面的换挡拨片很低调，同时Q3三款产品都标配了换挡拨片。
在音响和空调中间设置了一排按键，其中包括奥迪驾驶模式选项、自动启停、自动泊车、ESP、倒车雷达功能的相关按键。
空调面板则来自于现款奥迪A3，并没有采用奥迪传统的旋钮来调节温度，而是需要一档一档向左或向右波动。35TFSI舒适型和40TFSI运动型都没有标配电加热座椅，好在4000元的原厂选装价格并不算贵。
车内的氛围灯设计的也颇显心思，车门上Bose音响周围的白色光带与A1如出一辙，中央杯架里也有白色的氛围灯。奥迪Q3全系标配全景天窗，电子手刹和AutoHold功能也减轻了拥堵路段的操作难度。
从车身参数指标上就能看出，Q3并不是一辆主打车内空间的产品。
