1998年，一汽-大众对捷达的前脸和车尾作了重新设计，推出了改脸的新款捷达。第一辆装有ABS的新捷达王轿车面世，开国内A级轿车批量安装ABS先例，使得防抱死刹车系统不再是高档豪华轿车的专利。

1998年国产改款捷达

　　1999年，装备了自动变速箱的捷达都市先锋上市，这是国内率先问世的自动档轿车。同年3月，捷达GTX正式注册为国际N组比赛用车，成为“中国第一辆跻身国际标准赛车行列的国产轿车”。9月，在世界拉力锦标赛中国赛站中，捷达作为“中国首款赛车参与国际顶级赛事竞争”，一汽-大众与珠海FRD赛车公司同时在该项赛事中创建了“国内首支有本国汽车厂商参与的专业车队”。10月20日，捷达投产单缸2气阀电喷发动机，成为国内率先实现发动机全电喷化的轿车，排放达到欧洲Ⅱ号标准，对我国的环保事业的发展起到了积极作用。

　　2001年7月26日至12月14日，汽车旅行探险家、旅行作家廖佳驾驶捷达GTX完成历时142天，穿越32个国家，行程60522公里的横跨欧亚大陆之旅。

　　2002年3月，捷达月销售量首次突破万辆大关。6月6日，中国第一辆国产柴油轿车——捷达SDI在第七届北京国际汽车展会上亮相，开创了中国国产轿车的新动力时代。8月26日，捷达轿车首次登上全国单一品牌月销量冠军的宝座。

　　2003年，在珠海发现“捷达之家”，珠海市民谭先生从1993年开始，总共购买了10辆捷达，而其家族总共拥有的捷达数量达到了25辆。这是中国汽车品牌中绝无仅有的，一时间“捷达之家”被消费者传为佳话。

旧貌换新颜的第三代捷达

　　2004年3月25日，在保持原有动力强劲、皮实耐用、经济舒适等一系列优秀品质的基础上，捷达品牌进行了21项主要技术改进。同年9月，“一箱油穿越千里无人区”挑战活动在新疆库尔勒圆满举行。